使用隔音耳罩可能导致耳垢在耳罩插入耳道的同时被推进中耳,这能造成耳鸣,减弱听觉，疼痛或细菌感染。 耳垢过多的使用者应更小心地使用耳罩，且耳罩应经常用水和温和的肥皂清洗。然而，泡沫类型的耳罩通常都是用完即可丢弃的, 而且将其泡在水里弄干后可能会失去慢回弹的特性。
此外，隔音耳罩也有可能成为是耳炎的激发因素, 因为在温暖的，潮湿的环境下，许多细菌会繁殖得更旺盛。
然而，使用隔音耳罩通常是安全的，但必须预防一些长期使用可能出现的潜在危险:
插入隔音耳罩的时候会导致中耳的气压上升，并推向耳鼓导致疼痛，这是因为耳塞插入过深。为了避免这个危险，请先将耳塞搓细并插入预好的理想位置，当耳塞完全膨胀后最好不再往里推。反之亦然，拔出耳塞时为了避免耳鼓受挤，应慢慢地将耳塞旋出而不是强拉出来。