仙鹤草味苦、涩，性平；归心、肝经；具有收敛止血，截疟，止痢，解毒，补虚等作用；适用于咯血，吐血，崩漏下血，疟疾，血痢，痈肿疮毒，阴痒带下，脱力劳伤等症，一般内服用量为6～12g，外用适量。
从仙鹤草的功效来看，尤其是止血方面的“大内高手”，比如肺痨咯血，可以用新鲜的仙鹤草30克或干仙鹤草18克，白糖30克，先将仙鹤草捣烂，加冷开水半碗，搅拌均匀，榨取液汁，再加入白糖，一次服用。比如治疗吐血，可以用仙鹤草、鹿衔草、麦瓶草，水煎服。又比如治疗鼻血及大便下血，可以用仙鹤草、蒲黄、茅草根、大蓟等药水煎服。还比如治疗赤白痢疾以及咯血、吐血等症，可以用仙鹤草9~18克，水煎服。
仙鹤草在治疗妇科疾病方面，也是比较在行的，比如治疗妇人月经或前或后，有时腰痛、发热、气胀等症时，可以用仙鹤草6克，白芍药9克，川芎4.5克，香附3克，红花0.6克，水煎兑酒服用；如果兼有月经颜色紫黑的，可以酌情加入适量的苏木和黄芩；如果兼有腹痛的，可以酌情加入延胡索、小茴香等药。还比如治疗赤白带下或兼白浊，可用仙鹤草10克，马鞭草根3克，黑锁梅根6克，水煎后兑酒服用。
仙鹤草除了内服之外，外用也是一味良药，比如在痈、疔、疮以及阴道滴虫方面，可以用干品15~30g煎浓汁及熬膏涂患部，也可用鲜草50~100g捣烂外敷。