主要区别是，性质不同、用途不同、用料不同，具体如下：
一、性质不同
1、床笠
床笠是直接套在床垫上的布质罩子。
2、床单
床单是覆盖床面用的织物。
二、用途不同
1、床笠
主要用途是包裹床垫，床垫本身非常容易落灰弄脏，再加上人为的破坏，短时间就会变得很脏，清洗起来也非常的不便，床笠解决了这个问题。
2、床单
床上用品，起到卫生、装饰作用。是兼有实用性和装饰性的纺织品。
三、用料不同
1、床笠
由于床笠通常只是作为简单的床垫罩，面料一般很普通甚至简陋。
2、床单
以纯棉或混纺纱线为原料，一般采用阔幅手感柔软保暖性好的织物。
参考资料来源：百度百科-床笠
参考资料来源：百度百科-床单