高频变压器与功率变压器的共同用处是，变压与隔离。
高频变压器的目的在于，传输相同有功功率情况下，频率越高，体积越小，从而节省空间、体积、重量。
然而随着体积的变小，各接口间的空间距离变小，电气安全、散热等问题随之而来；而且，磁芯由硅钢片等硬磁材料，变为铁氧体等的软磁材料，变压器的机械强度更低。
其本质区别在于磁芯材料不同所带来的磁饱值与磁化曲线差异，体现出的就是工频变压器当成高频变压器使用后波形失真，原因在于，高频情况下，工频变压器磁饱和；具体原理与电感的设计也取决于其滤波频率相同。
参数设计时，所考虑的损耗、频率、饱和的基本原理都会发生变化。例如，经典斯坦梅茨损耗理论不再完全适用，因为高频变压器更多情况下传输能量并非正弦波形，会出现方波、三角波等。