开小方卯，类似题主所要求的大小，是日式接榫里面常用的，见下图。
大型的方卯，爱好者大多是用Plunge Router（国内好像叫电木铣）完成大致的孔径，然后用凿子修边。在做大型卯的时候，不管做的多么粗糙，误差大多可以修正。
做小型卯的时候，要求的精度和控制要比大型卯高得多。小型卯可以通过手工或者机械完成，但是如果要求精度控制到毫米级，建议还是直接用机器，it will make your life easier。
前面有人提到用Reuleaux摆去做方卯，这个方案一般用在硬质材料加工上，控制钻头滚摆幅度，可以做出来漂亮的方孔或者多边形孔。木头这种软质材料，用凿子就足够了。另外，Reuleaux摆在加工的时候钻头对工件的扰动比较大，加工木头的时候容易出现毛刺或者断裂，软木（比如辐射松），很容易就劈开断裂掉。
下面说两种做小方卯的方法：
一、电钻+凿子
题主的提出的方案是可行的，但是如果需要精确控制孔深和孔径，需要用几个工具：
1. 工具部分：
a. 游标卡尺、直角尺和划线笔
b. V-Drill Guide - 这玩意我不知道中文学名叫啥，淘宝搜索钻孔定位器可以搜出来类似的东西。见下图：
使用vertical drill guide的作用包括三方面：
一是消除水平误差，可以准确的定位你需要钻孔的位置，不会出现跑偏或者抖动而让钻孔偏离或者孔径扩大；
二是消除垂直误差，可以钻出来一个近乎垂直的钻孔，技能再高超的木工，在手持电钻的时候，钻孔角度也会出现一定偏差，大口径的钻头垂直误差不是特别明显，但是小孔径的垂直误差在孔径缩小的时候会被级数放大；
三是定位孔深，这个我后面会说具体怎么做。
c. 凿子。国内能够买到的木工凿，一般叫做Bevel Edge Chisel，也就是凿子的肩部是斜边的。这种凿子修大型的边角缝隙时候比较好用。见下图：
Bevel Edge Chisel的最大缺点是，修卯缝的时候容易歪。因为这类凿使用的时候只可能和工件的一面对应，在修内直角的时候，只有一个凿边（底边）能够作为参考，所以如果手上控制力度不够，下凿或者落槌的时候就容易向其它方向侵入，破坏整个卯孔的形状。
鉴于Bevel Edge Chisel的这一缺点，木工们引入了另外两种凿子：Mortise Chisel（听名字就知道是开卯用的）：
和Japanese Butt Chisel，见