既然是医疗行为，就会有后遗症、并发症的发生风险。从群体角度（流行病学）来看，后遗症、并发症都有一定的发生率，且是无法完全避免的。而且和医生的操作无直接关系。
后遗症：某种疾病痊愈或主要症状消退之后所遗留下的一些症状。后遗症有的消退得很慢，有的终生不消退并发症：并发症是指在诊疗护理过程中，病人由患一种疾病合并发生了与这种疾病有关的另一种或几种疾病。所以，可以直接理解为治疗风险。
医患沟通有个词特别常用，Informed consent——知情同意。
啥意思呢，就是医生告知（inform）患者其所患疾病的情况，（包括可能发生的后遗症、并发症等等风险），患者理解，并且同意治疗。
所以，正规的医疗机构和医生在正畸治疗前都会详细的解释正畸风险，签订知情同意书。
制式的知情同意书，内容比较陈旧了有些医生觉得某些风险较大的患者，甚至会在治疗计划中列出
口腔医疗行业因为大量资本的涌入，为了提高成交率，不可否认存在许多淡化风险，甚至题主所说的鼓吹正畸完美的机构、医疗从业者存在。这种机构和医生其实，是在给自己挖坑，因为不给患者明确风险，实际上就是把风险转嫁给机构和医生自己。
回归正题，正畸常见的并发症、后遗症有哪些?
由于本题只讨论不可控风险，医生技术不过关导致的“accident”，不在本题讨论之列。
第一大类：美学风险 1. 面颊凹陷/牙套脸
“牙套脸”的原因基本已经明确了，是戴矫治器之后，因为咬合不适造成的咀嚼肌（颞肌——太阳穴，咬肌——面颊部）萎缩，从而导致凹陷。
这类高风险人群有下面几个特征：成年女性、脸瘦（通常减肥先瘦脸）、颧骨高、长脸、需要拔牙矫正。
降低风险的措施：避免只吃精细食物，多吃一些需要咀嚼的食物，可以理解为锻炼咀嚼肌。另外一个办法就是增肥，软组织丰满之后，肌肉萎缩就不明显了。
对于一些短脸、咬肌肥大的患者，戴牙套之后的咬肌萎缩反而可以起到正面的作用
脸本来就是方形的就有点像牙套脸 带牙套以后会不会更丑啊 那种牙套脸？ - http://Dr.Li矫牙志的回答 - 知乎 https://www.zhihu.com/question/395651040/answer/1232983189
2. 法令纹加深
关于正畸治疗和法令纹的关系，最近一年多才有听说。我特意查了文献，基本没有相关资料，感觉和“牙套